Trong lời giới thiệu, tác giả viết: "Cuốn sách bắt đầu từ ngày 30-4-1975, ngày nhiều người tin là miền Bắc đã giải phóng miền Nam. Nhiều người thận trọng nhìn lại suốt hơn ba mươi năm, giật mình với cảm giác bên được giải phóng hóa ra lại là miền Bắc. Hãy để cho các nhà kinh tế chính trị học và các nhà xã hội học nghiên cứu kỹ hơn hiện tượng lịch sử này. Cuốn sách của tôi đơn giản chỉ bắt đầu kể những gì đã xảy ra ở Sài Gòn, ở Việt Nam sau ngày 30-4: cải tạo; đánh tư sản; đổi tiền… Cuốn sách của tôi cũng nói về hai cuộc chiến tranh cuối thập niên 1970, một với Khmer Đỏ và một với người Trung Quốc. Cuốn sách của tôi cũng nói về làn sóng vượt biên sau năm 1975, nói về sự "đồng khởi" của nông dân, của các tiểu chủ, tiểu thương để giành lấy cái quyền được tự lo lấy cơm ăn áo mặc.".[5]

Dưới đây là Mục lục:

Cuốn 1

Cuốn 1 của bộ sách Bên thắng cuộc có tên Giải Phóng, bắt đầu từ thời điểm "Cách mạng vào Thành phố".

• PHẦN I: MIỀN NAM

Chương I: Ba mươi tháng Tư: Đi từ bưng biền/ Xuân Lộc/ Tướng Big Minh/ Trại Davis/ Nguyễn Hữu Hạnh/ Sài Gòn trong vòng vây/ Xe tăng 390/ Đầu hàng/ Tuẫn tiết

Chương II: Cải tạo: Những ngày đầu/ "Ngụy Quyền"/ "Ngụy Quân"/ "Đoàn tụ"/ "Phản động"/ Tù và cải tạo/ "Thăm nuôi"/ "Học tập".

Chương III: Đánh Tư sản: "Chiến dịch X-2"/ Đổi tiền/ "Gian thương"/ "Cải tạo công thương nghiệp tư doanh"/ Hai gia đình tư sản/ Kinh tế mới

Chương IV: Nạn Kiều: Đội quân thứ năm/ Hiệp định Geneve/ "chổi ngắn không quét xa"/ Hoàng Sa/ Sợ "con ngựa thành Troy"/ "Nạn Kiều"/ "Phương án II"/ "Ban 69"/ Vụ Cát Lái.

Chương V: Chiến tranh: Biên giới Tây Nam/ Pol Pot/ Đi dây/ Khmer Đỏ và Campuchia dân chủ/ "Kẻ Thù Lịch sử"/ Thất bại trong tấn công ngăn chặn [Pre-emptive War]/ "Nhất biên đảo"/ "Áo lính lại khoác vào ngay".

Chương VI: Vượt biên: "Vượt biên"/ Từ "trí thức yêu nước"/ Đến "thường dân"/ Trước khi tới biển/ Trại tị nạn.

Chương VII: Giải phóng: Sài Gòn thay đổi/ Kinh tế mới/ Đốt sách/ Cạo râu/ "Cách mạng là đảo lộn"/ Lòng người/ Những người sinh ra không đúng cửa/ "Cánh cửa" Thanh niên xung phong/ Cửa không đủ rộng/ "Nổi loạn"/ "Sài Gòn lại bắt đầu ghẻ lở").

• PHẦN II: THỜI LÊ DUẨN

Chương VIII: Thống nhất: Nước Việt Nam là một/ "Bắc hóa"/ Chủ nghĩa xã hội/ "Con đường của Bác"/ "Mỗi người làm việc bằng hai"/ Lê Duẩn và mối tình miền Nam/ Chấp chính và chuyên chính.

Chương IX: Xé rào: Bế tắc/ Mậu dịch quốc doanh/ Máy bỏ không, công nhân cuốc ruộng/ Tháo gỡ/ Nghị quyết Trung ương Sáu/ Bù giá vào lương/ Cắm cờ xé rào/ Khoán chui/ Ông Kiệt xé rào, ông Linh lãnh đạn/ "Ai thắng ai".

Chương X: Đổi mới: Hội nghị Đà Lạt/ Nhóm giúp việc mới/ Người của những khúc quanh lịch sử/ Từ chính sách Kinh tế Mới/ Đến chọc thủng bức tường bao cấp/ Giá-Lương-Tiền/ Nã pháo vào bộ tổng/ Khép lại trang sử Lê Duẩn/ Vai trò của Mikhail Gorbachev/ Tuyên ngôn đổi mới/ Bàn tay Lê Đức Thọ/ Phút 89).

Chương XI: Campuchia: "Pot ở đầu phum ta cuối phum"/ "Xuất khẩu cách mạng"/ Tư tưởng nước lớn/ Bị cô lập/ Phương Bắc/ Hội nghị Thành Đô/ Campuchia thời hậu Việt Nam.

Cuốn 2

Cuốn 2 mang tên Quyền Bính

• PHẦN III: DẤU ẤN NGUYỄN VĂN LINH

Chương 12: Cởi trói: Những Việc Cần Làm Ngay/ Xiềng xích "Nhân văn"/ Miền Nam "giải phóng"/ Cởi ra…

Chương 13: Đa nguyên: Cải cách ở bậc đại học/ Sinh viên và các phong trào tự phát/ Đông Âu/ Cứu chủ nghĩa xã hội/ "Đa nguyên, đa đảng"/ Cách chức Trần Xuân Bách/ Kết thúc "trăng mật" với báo giới

Chương 14: Khoảng cách Linh – Kiệt: Tại sao Đỗ Mười/ Cimexcol hay "Vụ án Dương Văn Ba"/ Hai tính cách/ Hai cuộc hôn nhân/ Ở Việt Bắc/ Bà Trần Kim Anh/ Hai người con trai/ Đi bước nữa/ Vợ (bà Phan Lương Cầm) và bạn/ Cuộc sống và ý thức hệ

Chương 15: Tướng Giáp: Vụ án "Năm Châu – Sáu Sứ"/ "Cách mạng miền Nam"/ Sự kiện Vịnh Bắc Bộ/ Mậu Thân và tham vọng của Lê Đức Thọ/ "Nghị quyết 21"/ Chiến dịch Hồ Chí Minh/ "Thống chế đi đặt vòng"

• PHẦN IV: TAM NHÂN

Chương 16: Thị trường: Tái lập hòa bình/ Lạm phát & Nước hoa Thanh Hương/ Những bước đi đầu tiên/ Lược sử kinh tế tư nhân/ Học lại "kinh tế thị trường"

Chương 17: Tam quyền không phân lập: Nửa thế kỷ, bốn hiến pháp/ Quốc hội có vai trò hơn/ Thủ tướng và "người đứng đầu"/ Chia tỉnh/ "Công nông hoá" tư pháp/ "Bỏ Điều 4 là tự sát"

Chương 18: Tam nhân phân quyền: Bộ ba/ Gỡ cấm vận/ "Đa phương hóa"/ Tổng cục II/ Đất quân đội/ Hóa giá nhà/ Đường dây 500)

Chương 19: Đại hội VIII: Khúc dạo đầu/ "Thư gửi Bộ Chính trị"/ Vụ án Nguyễn Hà Phan/ Tam nhân tại vị/ Sức khỏe Trung ương

Chương 20: Lê Khả Phiêu và ba ông cố vấn: Kỷ nguyên Internet/ Luân chuyển cán bộ/ "16 chữ vàng"/ Hiệp định thương mại Việt-Mỹ/ Bill Clinton và Lê Khả Phiêu/ Đại hội IX)

Chương 21: Định hướng xã hội chủ nghĩa: Quốc doanh chủ đạo/ Thị trường và lập trường/ Phan Văn Khải/ "Sân chơi" không bình đẳng

Chương 22: Thế hệ khác: Người kế nhiệm/ Kinh tế tập đoàn/ Nông Đức Mạnh/ "Phương án" Nguyễn Văn An/ Sở hữu toàn dân